ときは戦國時代(せんごくじだい)。 先祖(せんぞ)だいだい、ヒラ忍者(にんじゃ)の傢に生まれた 亂太郎(らんたろう)は、一流(liu)(いちりゅう)の忍者になってほしいという 両親(りょうしん)のきたいをむねに、 忍術學園(にんじゅつがくえん)に入學(にゅうがく)。
　　そこには堺(さかい)の豪(hao)商(ごうしょう)のむすこ・しんべヱや、 いくさで親(おや)をなくしながらもたくましく生きるきり丸がいた。
　　忍術學園のせいとは忍者のたまご、『忍たま』とよばれる。 忍術(shu)學園(yuan)には、ナゾの天才(てんさい)忍者だった 學園長(がくえんちょう)をはじめ、 ユニークな先(xian)生(せんせい)や上(shang)級生(じょうきゅうせい)、 ちょっと手ごわい「くの一教(jiao)室(shi)(きょうしつ)」の女の子たちや 忍犬(quan)(にんけん)ヘムヘムなどがいて、とってもにぎやか！