ときは戦國時代(せんごくじだい)。 先祖(せんぞ)だいだい、ヒラ忍者(にんじゃ)の傢(jia)に生まれた 亂太(tai)郎(らんたろう)は、一流(いちりゅう)の忍者になってほしいという 両親(qin)(りょうしん)のきたいをむねに、 忍術學園(にんじゅつがくえん)に入學(にゅうがく)。
　　そこには堺(jie)(さかい)の豪(hao)商(ごうしょう)のむすこ・しんべヱや、 いくさで親(おや)をなくしながらもたくましく生(sheng)きるきり丸がいた。
　　忍(ren)術學園(yuan)のせいとは忍者のたまご、『忍たま』とよばれる。 忍術學園には、ナゾの天(tian)才(cai)(てんさい)忍者だった 學園長(がくえんちょう)をはじめ、 ユニークな先生(せんせい)や上(shang)級(ji)生(じょうきゅうせい)、 ちょっと手ごわい「くの一教室(きょうしつ)」の女の子たちや 忍犬(にんけん)ヘムヘムなどがいて、とってもにぎやか！