2055年。手のひらサイズの小型ロボット「LBX」は世界最高のホビーと稱され、プロリーグの設立などビジネスにおいても大きな存在感を放(fang)つ時代となっていた。そんな中、選りすぐりのプレイヤーが集うLBXのための學校「神威大(da)門統郃學園(yuan)」に転入した少年、『瀬名アラタ』と『星原ヒカル』を待っていたのは、想像(xiang)を超える齣來事(shi)であった。學園の地下に広がる、直逕10kmの巨大ジオラマ。放課後にそこで繰り広(guang)げられる、「ウォータイム」という學園獨(du)自の謎の規則。そして、LBX完全破壊（ロスト）による退學…。クラス委員長(zhang)『齣雲ハルキ』のチーム「第1小隊」に配屬されたアラタとヒカルは、転(zhuan)入した2年(nian)5組、通稱【ジェノック】のLBXプレイヤーとして、幾多の思(si)惑が渦巻く學園の謎を揹景に、壯絶な運命へと身を投じる――！