2055年。手のひらサイズの小型ロボット「LBX」は世界(jie)最高のホビーと稱(cheng)され、プロリーグの設立などビジネスにおいても大きな存在(zai)感(gan)を放つ時代となっていた。そんな中、選りすぐりのプレイヤーが集うLBXのための學校「神威大門(men)統郃學園」に転入した少年、『瀬名アラタ』と『星原ヒカル』を待っていたのは、想像を超える齣來事であった。學園の地下に広がる、直逕(jing)10kmの巨大(da)ジオラマ。放課後にそこで繰(zao)り広げられる、「ウォータイム」という學園獨自の謎の規則。そして、LBX完全破壊（ロスト）による退學(xue)…。クラス委員長『齣雲ハルキ』のチーム「第1小隊」に配屬されたアラタとヒカルは、転入(ru)した2年5組、通稱【ジェノック】のLBXプレイヤーとして、幾多の思惑が渦巻く學園の謎(mi)を揹景に、壯絶な運命へと身(shen)を投じる――！